日本浙江大学校友会由留日浙江大学的校友自愿组织而成。

11月16日，部分在日本的浙大校友自发成立了日本浙大校友会，并开始各种交流活动。四校合并之后，为了进一步加强在日校友之间的交流，由原校友会的部分理事为骨干，联合在日学习和工作的原浙大，杭大，农大和医大的毕业生一起，开始筹备新的日本浙江大学校友会。2006年4月16日，来自日本全国各地的留日浙大校友在位于东京的中国大使馆教育处召开校友大会。与会代表通过了《日本浙江大学校友会章程》。并选举产生了校友会理事会以及校友会会长、副会长和秘书长。宣告日本浙江大学校友会正式成立。

日本浙江大学校友会的宗旨是聯誼校友，回報母校，貢献社会。校友会理事会期望通过各种交流活动，加强校友之间，校友与母校以及与其他国家和地区的校友会之间的联系与沟通；为校友提供各种信息及各种可能的协助；团结广大在日校友共同为祖国、为地方、为母校的发展作出贡献。

目前，日本浙江大学校友会已有总会，以及关西分会、九州分会，青年分会和美食会等各种分会，逐步形成了日本浙江大学校友会校友联络网。正在把众多的浙大校友凝聚成一个团结友爱的整体。